黃鱔不是雌雄同體。黃鱔性逆轉性，其初期為雌性，后期會轉雄性。所對黃鱔進行準確的識別雌雄時，一般均需在繁殖季節到來之前。有經驗的養殖人員也可利用其個體差別、生長周期、外形等進行較為準確的推斷。

黃鱔的繁殖分為無土自然繁殖、有土自然繁殖以及半人工繁殖。目前黃鱔在人工養殖中，多數采用半人工繁殖方式。鱔魚繁殖方式為卵生，生殖季節約在6-8月，在其個體發育中，具有雌雄性逆轉的特性，即從胚胎期到初次性成熟時都是雌性（即體長在35厘米以下的個體的生殖腺全為卵巢）；

產卵后卵巢逐漸變為精巢；體長在36-48厘米時，部分性逆轉，雌雄個體幾乎相等；成長至53厘米以上者則多為精巢。黃鱔產卵在其穴居的洞口附近，產卵前口吐泡沫堆成巢，受精卵在泡沫中借助泡沫的浮力，在水面上發育，雌雄魚都有護巢的習性。產卵時成魚吐泡沫，在洞口積聚成團，卵量較少，不產于泡沫中，產在巢里，約7-8天可孵出幼魚。

黃鱔生殖季節約在5～8月，在其個體發育中，具有雌雄性逆轉的特性，即從胚胎期到初次性成熟時都是雌性（即體長在35厘米以下的個體的生殖腺全為卵巢）；產卵后卵巢逐漸變為精巢；體長在36～48厘米時，部分性逆轉，雌雄個體幾乎相等，屬于雌雄同體動物；成長至53厘米以上者則多為精巢。當年幼魚只能長到20厘米，2冬齡的雌魚才達成熟期，體長至少為34厘米。最大個體可達70厘米，重1.5公斤。2013年5月湖州有人捕到一條3·6斤、1.5米長的黃鱔。黃鱔產卵在其穴居的洞口附近，產卵前口吐泡沫堆成巢，受精卵在泡沫中借助泡沫的浮力，在水面上發育，雌雄魚都有護巢的習性。